Z obowiązku sporządzania dokumentacji podatkowych w zakresie cen transferowych nakreślonych przez art.9a ustawy o podatku dochodowym od osób prawnych wynikają poważne sankcje materialne oraz karne skarbowe. Brak dokumentacji cen transferowych w dokumentacji podatkowej przedsiębiorcy grozi poważnymi karami materialnymi oraz prawnymi.